Benátky sú vybudované na poloostrove a 117 ostrovoch, ktoré sú popretkávané 177 kanálmi v plytkej Benátskej lagúne. Ostrovy a jednotlivé časti mesta spája 409 mostov.
Hlavná časť mesta je rozdelená na 6 historických časti, ktoré sa nazývajú sestieri. Sú to najsevernejšia časť Cannaregio, San Polo, Dorsoduro (spolu s Giudecca a Isola Sacca Fisola), najznámejšia časť San Marco (spolu s ostrovom San Giorgio Maggiore), Santa Croce a Castello.